Science-kommuner byggede på idéen om, at børn og unges interesse for naturfag og teknik kan styrkes, hvis alle gode kræfter inden for kommunegrænsen spiller sammen.
I projektet havde 25 danske kommuner etableret sig som Science-kommuner.
Projektet byggede videre på erfaringer fra det veldokumenterede projekt Science Team K, og efter projektets formelle afslutning arbejdede mange Science-kommuner fortsat for en bedre udnyttelse af naturfagsressourcerne.
Science-kommuner havde politisk opbakning til en koordineret naturfagsindsats, kommunale naturfagskoordinatorer, der koordinerer alle udviklingstiltag på naturfagsområdet, en naturfagsstrategi med udgangspunkt i kommunens forudsætninger, et netværk af aktører fra formelle og uformelle læringsmiljøer, virksomheder, forvaltninger samt kommunalpolitikere.
Projekt Science-kommuner blev evalueret af Københavns Universitet.